ดีเอ็นเอเครื่องหมายกับการปรับปรุงพืชและสัตว์ ในการศึกษาระดับยีน นอกจากต้องการทราบโครงสร้างหน้าที่ และการทำงานของยีนแล้ว ยังต้องการทราบตำแหน่งของยีนแต่ละยีนว่าอยู่บนแท่งโครโมโซมใด ที่ตำแหน่งใด และยีนแต่ละตัวอยู่ห่างกันแค่ไหน ซึ่งเปรียบเสมือนแผนที่ยีน เช่น ข้าวมีโครโมโซม 12 แท่งลักษณะบางอย่างถูกควบคุมด้วยยีนตำแหน่งเดียว เช่น ยีนความหอมอยู่บนโครโมโซมแท่งที่ 8 บางลักษณะมียีนควบคุมหลายยีนกระจายอยู่บนหลายโครโมโซม เช่น ยีนทนแล้งกระจายอยู่บนโครโมโซมแท่งที่ 1, 3, 4, 8 และ 9 ยีนทนน้ำท่วมอยู่บนโครโมโซมแท่งที่ 5 และ 9 การรู้ตำแหน่งของยีน นำไปใช้ประโยชน์ในการคัดเลือกพันธุ์พืชและสัตว์ที่ได้จากการผสมพันธุ์ เพื่อการปรับปรุงพันธุ์โดยการคัดเลือกพันธุ์ผสมที่มียีนที่ต้องการตรงตำแหน่งนั้นอยู่ด้วย ในกรณีที่ไม่ทราบตำแหน่งแน่นอนของยีนที่ต้องการ สามารถใช้ยีนเครื่องหมายที่อยู่ใกล้เคียงกันเป็นยีนคัดเลือกแทน เนื่องจากยีนที่อยู่ใกล้เคียงกัน มักถูกถ่ายทอดไปด้วยกัน ยีนเครื่องหมายนี้ เรียกอีกอย่างว่า “เครื่องหมายดีเอ็นเอ” บรรณานุกรม : กิตติมา ไกรพีรพรรณ, ผจญภัยไปกับโลกใบเล็ก ตอนมหัศจรรย์ดีเอ็นเอ กรุงเทพฯ : ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ, 2551